I sjeldne tilfeller oppstår det kreftsvulster i penis. Hvilken behandling som skal utføres er avhengig av svulstens størrelse, eventuell spredning til lymfeknuter og innvekst i kar.
I noen tilfeller er det nødvendig å gjennomføre penektomi, det vil si at penis fjernes helt eller delvis. I siste tilfelle kan mannen fortsatt få ereksjon og gjennomføre et samleie og den innerste delen av penis, roten, er tilstrekkelig følsom til at han kan få orgasme.
Evnen til å tilfredsstille en kvinne ved hjelp av penis behøver heller ikke være vesentlig redusert, i og med at det er de ytre deler av vagina som er de mest følsomme. Når hele penis er borte må seksuell stimulering konsentreres om andre følsomme deler av huden, og ofte kan pasienten fortsatt få orgasme på denne måten.
Tross alt er bare en mindre del av menneskets seksualitet knyttet direkte til kjønnsorganene, og en kan ha glede av seksuallivet også etter å ha gjennomgått total penektomi. I noen få tilfeller er det mulig å lage en ny penis fra hud av underarmen, og plassere en protese inne i den konstruerte penisen. Dette er avansert kirurgi som krever mange operasjoner. Hvis en lurer på om en slik løsning er mulig, må det tas opp med behandlende kirurg.
